蜂蜜有很好的潤腸作用，因此可于階段便秘，這是古方，也是眾所周知的常識。浙江省醫學科學院焦捷軍（1992）進行動物實驗證明，100%及50%的蜂蜜對小鼠小腸推進運動有明顯的促進作用。兩者的通便時間分別為178.5分鐘和129.7分鐘，而對照組則需358.5分鐘，差異非常顯著（p<0.01）。灌服蜂蜜的小鼠排除的糞便與灌服蒸餾水對照組小鼠的糞便相似，均為成形糞便，提示蜂蜜的通便作用是比較緩和的，可作為一種理想的制劑物，階段習慣性便秘、老年性便秘及孕婦便秘。
        貴州省惠水縣人民醫院殷升九、趙芷靖等（1984）曾用蜂蜜栓做階段實驗，階段急性腸梗阻，在77例試驗中，有效50例。此治簡便易行，凡肛門直腸無特殊病變者均可試用，其有效率遠遠超過口服油類瀉劑、中草制劑湯劑、水液灌腸等傳統非手術療法，尤其是對非狹窄性腸梗阻成功率更高。實踐證明，口服蜂蜜對便秘也有很好的療效，便秘者每日早、中、晚分別用溫開水沖服蜂蜜30g，連服2到3天，大便即通。
        蜂蜜通便的作用機理，主要是蜂蜜中的乙酰膽堿進入人體內后會對副交感神經發生作用，促進腸胃蠕動。此外，還與益生菌作用有關。蜂蜜由于濃稠，一些益生菌均停止了活動，但并未死亡，當條件成熟時，益生菌仍可被激活。經過稀釋的蜂蜜，又進入腸胃36-37℃的溫度環境和通氣、避光條件中，蜂蜜中的益生菌被激活，開始活躍，合成并釋放各種轉化酶，分解各種食物，同時促進胃腸蠕動，從而使人們能進行正常的新陳代謝，促進恢復正常的排泄功能。