人們將蜂蜜作為治療和保健品，已有悠久的歷史。1800年前，張仲景著《傷寒論》將蜂蜜用于多種治病方劑，并已發明用蜂蜜栓劑治療便秘。明代醫藥家李時珍在《本草綱目》中列舉用蜂蜜治病的處方達20余種。現代醫學證明，蜂蜜適用于治療肝、腎、心血管和呼吸道等疾病。蜂蜜有保肝作用，能促進肝細胞再生，對脂肪肝的形成有抑制作用。蜂蜜有利于胃腸病、肺結核、貧血和手術后等患者的康復。
經常食用蜂蜜的兒童，體重增長較快，血紅蛋白增高，對疾病抵抗力增強。老人服用蜂蜜有助于消化系統的保健；
天然成熟的蜂蜜具有抗菌和促進創傷口愈合的作用，外用能治療下肢慢性潰瘍、皮膚創傷、口腔潰瘍、小兒鵝口瘡、凍傷、灼傷和一些皮膚病。
在許多護膚膏和美容劑的配方中，都含有蜂蜜成分。蜂蜜是藥劑學中常用的矯味劑、賦形劑、與粘合劑，傳統的中成藥多用煉蜜制成丸劑。